Biomonitoring van aquatische milieus in het Amazonegebied met behulp van DNA uit het milieu

Traditionele biomonitoring van aquatische ecosystemen is tijdrovend, duur en vereist uitgebreide taxonomische kennis. Monitoring op basis van DNA heeft deze nadelen niet, maar er is wel een uitgebreide database nodig met DNA-sequenties van alle doelsoorten.

In dit project wordt zo'n database ontwikkeld voor macro-invertebraten, vissen en amfibieën in het Ecuadoraanse Amazonegebied, een van de meest diverse, maar ook bedreigde gebieden van Ecuador. Er wordt een op DNA gebaseerde monitoringtechniek ontwikkeld die gebruik maakt van Next Generation Sequencing (NGS). NGS kan een breder en completer beeld geven van het bemonsterde ecosysteem en de aanwezigheid van invasieve soorten of verstoringen van het ecosysteem in een vroeg stadium aangeven.

Onze NGS-monitoringresultaten zullen vergeleken en gevalideerd worden met klassieke, op vangst gebaseerde monitoring. Bovendien zullen trekvissen gemerkt worden en zal hun aankomst in het studiegebied gedetecteerd worden via telemetrie. Tot slot zal dit project de capaciteit van zowel IKIAM als ESPOL aanzienlijk vergroten. Biodiversiteitsstudies zullen zeer efficiënt en kosteneffectief worden, waardoor frequentere monitoring mogelijk wordt.